El Ayuntamiento es el órgano representativo municipal por excelencia, que se define como el órgano de gobierno y administración del municipio, integrado por el Alcalde y los concejales.

Los concejales son elegidos por los vecinos mediante sufragio universal, igual, libre, directo y secreto, mientras que el alcalde será elegido por los concejales.

En la estructura del Ayuntamiento de Sagunto se distingue entre la organización propia de la Corporación, los Organismos Autónomos y una sociedad anónima municipal.

El alcalde es el órgano unipersonal, Presidente de la Corporación y jefe de la administración municipal.
Entre sus competencias, cabe resaltar las de dirigir el gobierno y administración municipal, representar al Ayuntamiento, dictar bandos, presidir las sesiones del Pleno y de la Comisión de Gobierno, ejercer la jefatura superior del personal y nombrar a los tenientes de Alcalde , entre otras.

En el Ayuntamiento de Sagunto el alcalde es D. Darío Moreno Lerga, perteneciente a PSOE.

En caso de vacante, ausencia o enfermedad del Alcalde es sustituido por los Tenientes de Alcalde, que son nombrados y revocados por el Alcalde de entre los concejales que son miembros de la Comisión de Gobierno, sin que su número pueda exceder del de ésta.

Actualmente hay designados los siguientes Tenientes de Alcalde, que son, por el orden de su nombramiento:

        1. Dª María José Carrera Garriga

        2. D. Guillermo Sampedro Ruiz

        3. D. Josep Francesc Fernandez Carrasco

        4. D. Javier Raro Gualda

        5. Dª Asuncion Moll Castelló

        6. Dª Gloria María Parra Calero

        7. D. Josep Maria Gil Alcami

        8. D. Francisco Alejandro Sotoca  Ruiz​